本届药交会，其目标是“发展樟树药业，振兴中国药都，弘扬中医药文化，促进人类健康和谐”，主题突出“创新•传承•合作•共赢”，共划分成三大板块，分别是经济贸易、学术交流、文化宣传。
本届药交会，着力于塑造服务江西中医药发展的优势平台，推动江西中医药强省建设。在此期间，会举办2016年江西省中医药产业招商引资推介会，以及项目签约仪式，还有江西省医药产业联盟成立仪式，另外还会举办2016中国•樟树中医药健康产业发展论坛暨院士论坛等11项活动。向全省医药企业发出倡议的仁和集团，要推动建立一个“医药产业联盟”，此联盟以企业为主体、以市场为导向、政产学研商相结合，助推江西医药企业投融资对接还有合作以及科技成果的转化应用，推动江西中医药往外走。到那时，全省会有115家医药企业参与进来。
此次举办的药交会着重突出中药所具备的特色，所邀请前来参展的企业主要是中药企业以及中药保健品企业，将会有700多家药企前来参与展会。其中，省外前来参展的药企所占比例超过了八成，国内一线品牌的药企有30余家。与此同时，各个分项活动的内容也都是以中药作为主要内容，像是中国中药材合作社发展交流会、2016中国•樟树中医药健康产业发展论坛暨院士论坛、“热敏灸”体验活动等等。为了将中医药文化予以弘扬，大会另外还特意精心安排了传统中药材炮制技艺的展示活动以及“热敏灸”体验活动，使得有参会代表能够在现场去领略樟树老药工所具备的高超技艺，并且能够亲身去感受中华医学所拥有的独特魅力。
记者从发布会上获悉，为了更加优秀地宣传樟树历史文化，展示樟树经济社会发展成果，樟树各大企业和协会组织还预备了樟树剪纸艺术展，《幸福樟树入镜来》摄影展，光正之夜—“武林风”走进药都樟树等文化活动，为药交会聚集更高的人气。
除此之外，对于市民所关心的中医药打假这一问题，在药交会举办期间，组委会会抽调药监局人员，抽调市场监管局人员，抽调公安局等有关部门的人员，组成打假处，加大投入使得对中药材市场的监管力度增强，加大投入使得对会展周边的巡查力度增强，坚决打击假冒伪劣药品的行为，坚决打击制假售假的行为，以此维护“中国药都”的良好声誉。