这三只最负盛名的神鸟，必须全部捕捉到，急冻鸟位于双子岛瀑布的隐秘之处，需借助推石阻断水流才能发现；闪电鸟藏匿于无人值守电厂的核心地带，而火焰鸟则盘踞在火山之巅，它们的级别均在五十上下。
超梦是超能系中最为顶尖的神兽，需要先做完红蓝宝石的任务，再前往花田洞穴最里面去战胜它，这个家伙的等级达到了70级，相当难对付，最好准备一些恶属性的精灵来对抗。另外，三圣兽，也就是雷公、炎帝和水君，在成功通关之后，会随机出现在关东地区的草丛中，不过它们的出现时机比较难以预测，需要多去探索才能遇到。
此外，某些特定区域还分布着其他罕见灵兽，例如凤王与洛奇亚，它们分别位于第八座彩虹岛的左上角和右下角，等级都达到70级，捕捉起来颇具挑战性，而迪奥西斯则栖息在第九座彩虹岛，需要先解开拼图谜题才能遇见，它的等级为30级，相对来说更容易捕捉。要是偏爱神秘风格，可以前往幽灵塔的最高处寻找吉拉奇，又或者去双子岛动用超级钓竿，看看是否有机会钓获海皇牙。古拉顿则位于1号岛的火焰山深处，而天空之龙裂空坐会在通往冠军的道路第二阶段迎接挑战。
想要成功驯服这些传说中的生物，前期准备必须认真对待。需要挑选匹配的精灵，例如岩石属性的精灵可以用来对抗电属性鸟类，水属性精灵则对火属性鸟类效果更佳。同时要准备充足的强力捕捉工具和稀有药剂，以便在遭遇目标生物时增加捕获机会。如果挑战过程过于艰难，不妨先提升精灵等级，等实力达标后再进行捕捉行动。某些神兽的现身条件十分独特，例如三圣兽需待闯关成功方可遇见，超梦则须达成特定要求，因此恒心与谋略都相当关键。