官方推出的正版游戏包括火红与叶绿以及红蓝绿宝石系列，国内玩家更常玩到的是386版本和漆黑的魅影这类修改过的作品，它们同样很有意思。各个版本都有自己的优点，挑选时得看个人更喜欢独立游玩还是故事体验。作为初代游戏的复刻版，火红与叶绿继承了原版剧情，同时对画面和玩法做了改进，比较适合怀念老游戏的玩家。红宝石和蓝宝石推出了双人竞技模式，并配备了全新机制，绿宝石则以此为基础进行了改进，又增添了战斗边境等新元素。
386版本攻克了独自游玩玩家获取全部图鉴的阻碍，把必须联网才能提升的宝可梦改成通过等级成长，还在某些特定区域设置了各世代传说中的宝可梦，这种更新虽然与最初的设计思想有所区别，但显著增强了单人游戏体验，漆黑的魅影被国内玩家公认为水准极高的重制版本，它不仅包含了第四和第五世代的宝可梦，还设计出情节曲折的三重故事线，整体背景设定周密，捕捉传说中的宝可梦流程更加庄重。圣灰版本精确再现了动画中的情节发展，玩家可以借助小智的目光，去感受无印篇章的冒险经历。
喜欢挑战的玩家会发现，究极绿宝石收录了全部精灵，还增加了超级进化等新玩法，让游戏更加丰富。同时，液体水晶补上了GBA缺少第二世代作品的空白，重新设计了金银版的双地图模式。这些更新在维持基本规则不变的情况下，通过加入新场景，改变精灵出现位置，以及改进AI战斗逻辑，让玩家获得与众不同的游戏感受。某些版本更新后会出现适配障碍，例如绿宝石386在通过关卡时可能会陷入停滞状态。
从游戏制作角度而言，官方版本更注重系统平衡，比较适合刚开始玩这个系列的玩家。改版版本则在内容丰富度上表现更好，特别是漆黑的魅影，凭借原创故事和跨越不同时代的精灵，创造了比原版更加宏大的故事格局。在技术方面，大部分改版都对GBA的硬件特点进行了适配，画面效果和操作体验不比正式作品差。挑选时要注意辨别原版改版和劣质二次修改的版本。
各个版本都继承了捕捉、训练、竞技的基本玩法，不同点在于扩展内容和系统调整上。不论挑选哪个版本，GBA平台上的精灵宝可梦游戏都能带来数十个小时的沉浸式探索过程。